{"id":1024,"date":"2017-09-13T09:21:19","date_gmt":"2017-09-13T14:21:19","guid":{"rendered":"http:\/\/www.kantoborgy.com\/?p=1024"},"modified":"2024-03-04T19:00:54","modified_gmt":"2024-03-05T00:00:54","slug":"tetraedros-de-la-vida","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/?p=1024","title":{"rendered":"Tetraedros de la Vida"},"content":{"rendered":"

Acerca de la Taxonom\u00eda, y las bases de datos de biodiversidad<\/strong><\/p>\n

embebidas en s\u00f3lidos plat\u00f3nicos, tetraedros y no pol\u00edgonos de dos dimensiones.<\/strong><\/p>\n

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El manejo de datos de biodviversidad que con ardua depuraci\u00f3n se convierte en informaci\u00f3n, tiene desde hace algunos a\u00f1os estructura relacional, es decir han pasado de los cuadernos y libros manuscritos a hojas electr\u00f3nicas y finalmente a bases de datos (siempre hay contraejemplos). En la actualidad se continua el manejo de datos de biodiversidad de manera estrictamente alfanum\u00e9rica, y con el advenimiento de la informaci\u00f3n espacial (coordenadas, sistemas de georeferenciaci\u00f3n) err\u00f3neamente a la tabla n\u00facleo de campos alfanum\u00e9ricos simplemente le a\u00f1aden uno adicional donde colocan la coordenada. Esto imposibilita el uso y aprovechamiento de las capacidades de las bases de datos espaciales para ejecutar an\u00e1lisis\u00a0 de informaci\u00f3n a nivel de capas, lo cual es no solo la tendencia actual tecnol\u00f3gica y desde hace ya diez a\u00f1os, sino la correcta forma de hacer an\u00e1lisis de un g\u00fagolplex de datos.<\/p>\n

Las actuales estructuras de bases de datos modelo para el manejo de informaci\u00f3n de biodiversidad, b\u00e1sicamente Especies, G\u00e9nero, Familia, Orden, Clase… hasta llegar al Reino, de todas las clasificaciones de la vida, Animales, Plantas, Hongos, Chromista, Archeae, Etc. tienen como n\u00facleo de la estructura de entidad relaci\u00f3n a la Taxonom\u00eda, espec\u00edficamente a Especie y G\u00e9nero a estos campos fundamentales asocian otro tipo de datos como sexo, ubicaci\u00f3n pol\u00edtica, tipso de muestra, peso, medidas, coordenada de avistamiento o colecta, Etc. Evidentemente\u00a0 con el tratamiento de una base de datos alfanum\u00e9rica. Adicionalmente la taxonom\u00eda, siempre cambiante, est\u00e1 continuamente dentro de discusiones eternas en base a grupos y\/o cient\u00edficos que defienden clasificaciones y reclasificaciones, que solo\u00a0 acabar\u00e1 cuando se complete el an\u00e1lisis gen\u00e9tico y molecular, es decir cuando esta Taxonom\u00eda se revise en base a las cadenas de ADN de cada especie.<\/p>\n

Las especies en el planeta tierra existen bajo un sistema de cuatro dimensiones, latitud, longitud, altura o profundidad y tiempo. Los transectos que dise\u00f1an los bi\u00f3logos en sus estudios son de cuatro dimensiones, sean estos superficiales, submarinos, subterr\u00e1neos, \u00e1ereos. Las especies habitan el planeta en bloques tetradimensionales, como un paralelep\u00edpedo gelatinoso, claro esto por ser Plat\u00f3nico, porque realmente podr\u00edan ser de topolog\u00eda fractal . El correcto an\u00e1lisis de datos e informaci\u00f3n de biodiversidad y\/o el buscar patroes con otros modelos de datos como por ejemplo tornados, huracanes, saturaci\u00f3n de mol\u00e9culas de gases contaminantes, Etc. evidentemente como conclusi\u00f3n a lo antes citado es mediante geodatabases.<\/p>\n<\/div>\n

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El modelo correcto de una base de datos de biodiversidad es una geodatabase, en donde la pate central de la estructura de base de datos sea un pol\u00edgono y no datos alfanum\u00e9ricos como es la taxonom\u00eda. Los algor\u00edtmos matem\u00e1ticos de b\u00faqueda de patrones (que la mente humana mediante lenguaje estructurado SQL no puede hallar) haciendo uso de los grandes vol\u00famenes de datos( big data) no estructurados (NoSQL) mediante redes de simulaci\u00f3n neuronal y an\u00e1lisis cognoscitivo (Watson de IBM<\/a>, Machine Learning<\/a>, Etc.)<\/p>\n

Enormes capacidades de procesamiento para enormes vol\u00famenes de datos y\/o relacionamiento y b\u00fasqueda de patrones con otras capas tetradimensionales de informaci\u00f3n se encuentran disponibles para todos como SaaS (Software as a Service), en empresas como IBM, Google, Amazon, Microsoft,\u00a0 es decir que no es necesario hacer inversiones particulares, por cada universidad, instituto, gobierno, Etc. Existen verdaderos s\u00faper-ordenadores de gran capacidad de procesamieto gr\u00e1fico, num\u00e9rico y general (gpu, fpu, cpu, ver Nvidia<\/a> e Intel Phi<\/a>). Mi recomendaci\u00f3n ser\u00eda ya iniciar estudios de uso de estos \u00faper-ordenadores y sobre todo del computador cu\u00e1ntico de IBM que tiene 16 qubits IBM-Q<\/a> el tema de hacer uso de la superpocisi\u00f3n y entrelazamiento, principios de la mec\u00e1nica cu\u00e1ntica, son… elementos para dejar de pensar en la \u00absobernan\u00eda\u00bb<\/p>\n

Lamentablemente el celo de la ignorancia, y el mal entendido concepto de soberan\u00eda, o quiz\u00e1 solo el inter\u00e9s de obtener alguna prevenda en este tipo de adquiciones han hecho que se adquieran, algunas \u00abs\u00faper-computadoras\u00bb, atrevidamente as\u00ed llamadas. Soberan\u00eda ser\u00eda que las universidades hagan uso y aprovechamiento inteligente e innovador sobre lo ya dise\u00f1ado y desarrollado y puesto en producci\u00f3n por pa\u00edses que nos llevan d\u00e9cadas en investigaci\u00f3n cient\u00edfica plasmada en la tecnolog\u00eda que actualmente consumimos.<\/p>\n

El\u00a0 an\u00e1lisis presentado\u00a0 es el resultado de la ejecuci\u00f3n de prototipos en base a software libre como: Symbiota<\/a> de la NSF<\/a> y la Universidad de Wisconsin, y Specify<\/a> de la Universidad de\u00a0 Kansas) . Quiero pensar que a mediano plazo, el modelo del pa\u00eds no termine siendo una copia de Colombia, Brasil o Per\u00fa, Estados Americanos, Alemania,\u00a0 ni de ning\u00fan otro,\u00a0 y que lo proyectos como el Mapa de la Vida(MOL)<\/a>, los Bancos Biol\u00f3gicos de ADN<\/a> tambi\u00e9n realicen algo diferente.<\/p>\n

Finalmente, una decepci\u00f3n, no existe un modelo de geodatabase para la biodiversidad, hay que construirla y no es lo complicado, sino que si dicho modelo existiese tal como los modelos para gasoductos, oleoductos, acueductos, Etc. ( ESRI<\/a> y su ArcGis<\/a>)\u00a0 habr\u00eda un est\u00e1ndar lo cual es realmente importante.<\/p>\n<\/div>\n

PostData<\/strong><\/p>\n

Dont be a square… get a cube, or somthing better: get a bitcoin<\/strong><\/p>\n

Bacteria eats poison, poops out gold<\/strong><\/p>\n

Mi pr\u00f3ximo posr ser\u00e1 sobre Delftia acidovorans la bacteria que ingiere veneno y excreta oro Versus Santoshi Nakamoto y El Bitcoin,
\n Lea en b\u00edpedos Depredadores<\/sup><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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Leer m\u00e1s \u00abTetraedros de la Vida\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[275,1],"tags":[648,646,644,643,657,655,658,645,654,651,647,653,656,650,649,652],"class_list":["post-1024","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-comuna-moderna","category-uncategorized","tag-bank-of-life","tag-bases-alfanuericas","tag-bases-de-datos-biovidevsidad","tag-biodiversidad","tag-bitcoin","tag-computacion-cuantica","tag-delftia-acidovorans","tag-geodatabases","tag-ibm-q","tag-kansas","tag-map-of-life","tag-quantum-computing","tag-satoshi-nakamoto","tag-specify","tag-symbiota","tag-wisconsin"],"views":3340,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1024","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1024"}],"version-history":[{"count":17,"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1024\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1044,"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1024\/revisions\/1044"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1024"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=1024"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.kantoborgy.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=1024"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}